1. Per os (szájon át; történeti jelentőségű, ma már nem használatos)
2. Intramuszkuláris (izomba adott injekció)
3. Szubkután (s.c., bőr alá adott injekció)
4. Intradermal (i.d., bőrbe adott injekció)
5. Nazális (orrnyálkahártyára vitt hatóanyag – pl. orrcsepp)
A legtöbb kórokozó a nyálkahártákon valamint ritka esetlekben bőrön át hatol be. Olyan vakcinák amelyek biztositják már a behatolás helyén a védekezést, pld. IgA ellenanyagokkal biztonságossabbak és szélessebb védettséget adnak.